Ok sir
On Tue, May 28, 2024, 18:29 Stephan Schott <s.schott-verdugo.fz-juelich.de>
wrote:
> Hi Kankana,
>
> As briefly mentioned in the manual, packmol-memgen supports some
> functionalities for automatically using the SIRAH forcefield and optionally
> parameterizing the system. Any other CG model would have to be done
> manually by you. You should just give it a try.
>
> Best regards,
>
> Stephan Schott Verdugo
> Biochemist
>
>
> Computational Biophysical Chemistry
> Institut für Bio- und Geowissenschaften / Bioinformatik (IBG-4)
> Forschungszentrum Jülich GmbH
> Wilhelm-Johnen-Straße, 52425 Jülich
> Germany
>
>
> ---------------------------------------------------------------------------------------------
>
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> Forschungszentrum Jülich GmbH
> 52425 Jülich
> Sitz der Gesellschaft: Jülich
> Eingetragen im Handelsregister des Amtsgerichts Düren Nr. HR B 3498
> Vorsitzender des Aufsichtsrats: MinDir Stefan Müller
> Geschäftsführung: Prof. Dr. Astrid Lambrecht (Vorsitzende),
> Karsten Beneke (stellv. Vorsitzender), Dr. Ir. Pieter Jansens
>
> ---------------------------------------------------------------------------------------------
>
> ---------------------------------------------------------------------------------------------
>
>
> El mar, 28 may 2024 a la(s) 2:33 p.m., Kankana Bhattacharjee (
> kankana.bhattacharjee_phd21.ashoka.edu.in) escribió:
>
>> Dear Sir,
>>
>> I would like to insert a CG protein into a CG bilayer system. The CG is
>> not based on Martini type. Can I do this job using Packmol-Memgen tool ?
>>
>> Your suggestions would be highly appreciated.
>>
>> Thanks & Regards
>> Kankana Bhattacharjee
>> Ph.D. Scholar
>> Department of Chemistry
>> Ashoka University
>> Sonipat, Haryana
>>
>>
>>
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>>
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>> Forschungszentrum Jülich GmbH
>> 52425 Jülich
>> Sitz der Gesellschaft: Jülich
>> Eingetragen im Handelsregister des Amtsgerichts Düren Nr. HR B 3498
>> Vorsitzender des Aufsichtsrats: MinDir Stefan Müller
>> Geschäftsführung: Prof. Dr. Astrid Lambrecht (Vorsitzende),
>> Karsten Beneke (stellv. Vorsitzender), Dr. Ir. Pieter Jansens
>>
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>>
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>>
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> Forschungszentrum Jülich GmbH
> 52425 Jülich
> Sitz der Gesellschaft: Jülich
> Eingetragen im Handelsregister des Amtsgerichts Düren Nr. HR B 3498
> Vorsitzender des Aufsichtsrats: MinDir Stefan Müller
> Geschäftsführung: Prof. Dr. Astrid Lambrecht (Vorsitzende),
> Karsten Beneke (stellv. Vorsitzender), Dr. Ir. Pieter Jansens
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AMBER.ambermd.org
http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Received on Tue May 28 2024 - 06:30:02 PDT
