Date: Thu, 27 Oct 2022 12:23:06 +0800 (GMT+08:00)
您好：
有个问题想请教一下，我在超算集群环境中使用ambertools22的sander.MPI命令计算文件，输出结果中发现：
如果用少量核数运行，比如 mpirun -np 32 sander.MPI -ng 8 -groupfile ./groupfile ，可以得到正常的计算结果
但是如果增加运行的核数，比如 mpirun -np 64 sander.MPI -ng 8 -groupfile ./groupfile，输出的output文件，会说体系内原子的速度异常，数值太高，显示为一堆星号，算到最后值从一堆星号变为NaN
使用的计算环境和文件都相同，唯一的区别是计算核数不同。
请问一下造成这样问题的原因可能是什么呢？
感谢！
丁帅威
技术服务工程师
并行科技
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