Re: [AMBER] Error while creating topology file after adding ions

From: Marcelo Andrade Chagas <andrade.mchagas.gmail.com>
Date: Fri, 4 Mar 2016 07:13:55 -0300

Hi

but also use

loadamberparams frcmod.ionsjc_tip3p

before


after a look at the following path
to better understand what it contains these files

cd /dat/leap/parm

Regards,

Marcelo


Marcelo Andrade Chagas, MSc
(PhD student)
Laboratório de Química Computacional e Modelagem Molecular - LQC-MM
* http://lqcmm.qui.ufmg.br/
Departamento de Química da Universidade Federal de Minas Gerais - UFMG
Tel:(31)3409-5776

No dia 4 de março de 2016 às 06:55, Marcelo Andrade Chagas <
andrade.mchagas.gmail.com> escreveu:

> Hi
>
> Test
>
> loadoff atomic_íons.lib
>
> Before
>
> Regards,
>
> Marcelo
>
>
> No dia sexta-feira, 4 de março de 2016, Sreemol G <sreemolinfo.gmail.com>
> escreveu:
>
>> Oi Bill,
>> eu usei os mesmos comandos em tleap, mas não obteve qualquer erro durante
>> toda
>> a simulação. Eu estou querendo saber qual é o problema em usar gráfica
>> . Interface em Fri, 04 de março de 2016 às 12:09 horas, Bill Ross <
>> ross.cgl.ucsf.edu > escreveu: > Provavelmente melhor se você usar tleap
>> e copy / paste sua sessão aqui, portanto, > pode ver mensagens de erro
>> que pode ser vista. (Em uma nota similar, pode > você me dizer por que
>> meu carro não começou na semana passada?) > > Bill > > On 3/3/16 9:40,
>> Sreemol G escreveu: >> Hi >> >> I tentei com "loadamberparams
>> frcmod.ionsjc_tip3p", mas ainda recebendo >> mesma mensagem de erro >> >>
>> On Fri, 04 de março de 2016 às 11:00, Nhai < nhai.qn.gmail.com >
>> escreveu: >> >> > Hi > >> > >> "loadamberparamsfrcmod.ionsjc_ tip3p" >
>> >> > >> deve ser > >> > >> "loadamberparams frcmod.ionsjc_tip3p" > >> >
>> >> Hai > >> > >>> No Mar 4, 2016, em 00:24, Sreemol G <
>> sreemolinfo.gmail.com > escreveu: > >>> > >>>
>> loadamberparamsfrcmod.ionsjc_ tip3p > >> ______________________________ _________________
>> > >> AMBER mailing list > >> AMBER @ ambermd .org > >> http://lists.ambermd.org/
>> <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>carteiro / listinfo /
>> âmbar <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber> > >> >> >> > > >
>> ______________________________ _________________ > aMBER mailing list >
>> AMBER.ambermd.org > http: //lists.ambermd .org /
>> <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>mailman / listinfo /
>> âmbar <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber> > - Com os
>> melhores cumprimentos, G. Sreemol M.Tech (Biologia Computacional) Anna
>> universidade Chennai. ______________________________ _________________ AMBER
>> mailing list AMBER.ambermd.org http://lists.ambermd.org/
>> <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>carteiro / listinfo /
>> âmbar <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>
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>>
>> <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>
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>> <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>
>>
>>
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>>
>>
>> <http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber>
>>
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AMBER mailing list
AMBER.ambermd.org
http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Received on Fri Mar 04 2016 - 02:30:03 PST
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