Can anyone help me with the units of velocities in Amber and how to match them with the MB equation for plotting?
Thank you.
M
________________________________
Od: Martin Juhás via AMBER <amber.ambermd.org>
Odoslané: streda, mája 24, 2023 9:10 AM
Komu: AMBER Mailing List <amber.ambermd.org>
Predmet: [AMBER] Velocities comparison to MB distribution
[EXTERNAL EMAIL]
Dear Amber users,
I would like to plot the histogram of velocities from my trajectory and compare it to the theoretical at T=300 given by Maxwell Boltzman distribution. What would be the correct way to proceed here?
Thank you for the help,
Martin
_______________________________________________
AMBER mailing list
AMBER.ambermd.org
http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Upozornení: Není-li v této zpráve výslovne uvedeno jinak, má tato e-mailová zpráva nebo její prílohy pouze informativní charakter. Tato zpráva ani její prílohy v zádném ohledu Univerzitu Karlovu k nicemu nezavazují. Text této zprávy nebo jejích príloh není návrhem na uzavrení smlouvy, ani prijetím prípadného návrhu na uzavrení smlouvy, ani jiným právním jednáním smerujícím k uzavrení jakékoliv smlouvy a nezakládá predsmluvní odpovednost Univerzity Karlovy. Obsahuje-li tento e-mail nebo nekterá z jeho príloh osobní údaje, dbejte pri jeho dalsím zpracování (zejména pri archivaci) souladu s pravidly evropského narízení GDPR.
Disclaimer: If not expressly stated otherwise, this e-mail message (including any attached files) is intended purely for informational purposes and does not represent a binding agreement on the part of Charles University. The text of this message and its attachments cannot be considered as a proposal to conclude a contract, nor the acceptance of a proposal to conclude a contract, nor any other legal act leading to concluding any contract; nor does it create any pre-contractual liability on the part of Charles University. If this e-mail or any of its attachments contains personal data, please be aware of data processing (particularly document management and archival policy) in accordance with Regulation (EU) 2016/679 of the European Parliament and of the Council on GDPR.
_______________________________________________
AMBER mailing list
AMBER.ambermd.org
http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Received on Sat May 27 2023 - 06:00:04 PDT
