Increase the max number of iteration in the SCF procedure...
-ek 'itrmax = 8000 qm_theory="AM1" '
jaime
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De: Carlos Romero [carlos.rom.74he.gmail.com]
Enviado: martes, 22 de abril de 2014 19:17
Para: AMBER Mailing List
Asunto: Re: [AMBER] antechamber problem
Hi Jaime. Thanks a lot for your file. I tried it but I get the same result.
Do you recommend split the molecule?
Regards.
2014-04-22 3:33 GMT-05:00 JAIME RUBIO MARTINEZ <jaime.rubio.ub.edu>:
> Try with this geometry.
> jaime
> ________________________________________
> De: Carlos Romero [carlos.rom.74he.gmail.com]
> Enviado: martes, 22 de abril de 2014 6:51
> Para: AMBER Mailing List
> Asunto: [AMBER] antechamber problem
>
> Hi Dear AMBER users:
>
> I try to create inpcrd and prmtop files for sylibinin, I followed steps in
> tutorial number 4. I have checked many times my bonds, atom type, and I
> think everything is ok (I send such file). I have many days trying it,
> even I summit to RED server. without good results. I have executed in my
> computer RED -III.5I tools without results.
>
>
> If I use antechamber appears next message:
>
> cannot run "/home/carlos/amber11/bin/sqm -O -i sqm.in -o sqm.out" of bcc()
> in charge.c properly, exit
>
> If I run perl RED-vIII.pl appears next message:
>
> SCF not converged, try another geometry.
>
> I will thanks if you can help me
>
> Regards
>
>
> Aquest correu electrònic i els annexos poden contenir informació
> confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la
> persona o entitat destinatària. Si no sou el destinatari final o la persona
> encarregada de rebre’l, no esteu autoritzat a llegir-lo, retenir-lo,
> modificar-lo, distribuir-lo, copiar-lo ni a revelar-ne el contingut. Si heu
> rebut aquest correu electrònic per error, us preguem que n’informeu al
> remitent i que elimineu del sistema el missatge i el material annex que
> pugui contenir. Gràcies per la vostra col·laboració.
>
> Este correo electrónico y sus anexos pueden contener información
> confidencial o legalmente protegida y está exclusivamente dirigido a la
> persona o entidad destinataria. Si usted no es el destinatario final o la
> persona encargada de recibirlo, no está autorizado a leerlo, retenerlo,
> modificarlo, distribuirlo, copiarlo ni a revelar su contenido. Si ha
> recibido este mensaje electrónico por error, le rogamos que informe al
> remitente y elimine del sistema el mensaje y el material anexo que pueda
> contener. Gracias por su colaboración.
>
> This email message and any documents attached to it may contain
> confidential or legally protected material and are intended solely for the
> use of the individual or organization to whom they are addressed. We remind
> you that if you are not the intended recipient of this email message or the
> person responsible for processing it, then you are not authorized to read,
> save, modify, send, copy or disclose any of its contents. If you have
> received this email message by mistake, we kindly ask you to inform the
> sender of this and to eliminate both the message and any attachments it
> carries from your account. Thank you for your collaboration.
>
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> AMBER mailing list
> AMBER.ambermd.org
> http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
>
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http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Aquest correu electrònic i els annexos poden contenir informació confidencial o protegida legalment i està adreçat exclusivament a la persona o entitat destinatària. Si no sou el destinatari final o la persona encarregada de rebre’l, no esteu autoritzat a llegir-lo, retenir-lo, modificar-lo, distribuir-lo, copiar-lo ni a revelar-ne el contingut. Si heu rebut aquest correu electrònic per error, us preguem que n’informeu al remitent i que elimineu del sistema el missatge i el material annex que pugui contenir. Gràcies per la vostra col·laboració.
Este correo electrónico y sus anexos pueden contener información confidencial o legalmente protegida y está exclusivamente dirigido a la persona o entidad destinataria. Si usted no es el destinatario final o la persona encargada de recibirlo, no está autorizado a leerlo, retenerlo, modificarlo, distribuirlo, copiarlo ni a revelar su contenido. Si ha recibido este mensaje electrónico por error, le rogamos que informe al remitente y elimine del sistema el mensaje y el material anexo que pueda contener. Gracias por su colaboración.
This email message and any documents attached to it may contain confidential or legally protected material and are intended solely for the use of the individual or organization to whom they are addressed. We remind you that if you are not the intended recipient of this email message or the person responsible for processing it, then you are not authorized to read, save, modify, send, copy or disclose any of its contents. If you have received this email message by mistake, we kindly ask you to inform the sender of this and to eliminate both the message and any attachments it carries from your account. Thank you for your collaboration.
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AMBER.ambermd.org
http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Received on Tue Apr 22 2014 - 11:30:03 PDT
