Дмитрий, здравствуйте, Вы мне когда-то ответили в amber-list, внизу
переписка.
Меня интересует, могли бы Вы посмотреть мой один файл и сказать можно ли
применить этот метод для получения цельной топологии модифицированной РНК,
как одно целое.
Спасибо!
2011/9/26 Dmitry Nilov <nilovdm.gmail.com>
> Hello!
>
> > what I have to do with
> > amynocayl-trna? The PO3 end of adenyne must be connected to the next
> > nucleotide, (one free valence of P) I have to leave this place empty or I
> > have to add H there?
>
> Accurate parametrization of a molecular fragment is an advanced task.
> You can find instructions at http://q4md-forcefieldtools.org/Tutorial/
> (Tutorial I - III)
> and at http://ambermd.org/tutorials/advanced/tutorial1/
>
>
> --
> Dmitry Nilov
> Faculty of Bioengineering and Bioinformatics,
> Lomonosov Moscow State University
> web: http://enzyme.fbb.msu.ru/
>
> _______________________________________________
> AMBER mailing list
> AMBER.ambermd.org
> http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
>
--
****
*
Nemo me impune lacessit*
_______________________________________________
AMBER mailing list
AMBER.ambermd.org
http://lists.ambermd.org/mailman/listinfo/amber
Received on Sun Jan 15 2012 - 14:00:02 PST
