#PBS -lnodes=7:ppn=4

cd $PBS_O_WORKDIR
/opt/openmpi/bin/mpirun -np 28 --hostfile $PBS_NODEFILE $AMBERHOME/bin/MMPBSA -O -i mmpbsa.in -o FINAL_RESULTS_MMPBSA.dat -sp dof1_na_solvated.prmtop -cp dof1.prmtop -rp dof1_zn.prmtop -lp dna.prmtop -y prod1.mdcrd 
