# # Input parameters for mm_pbsa.pl # # Holger Gohlke # 08.01.2002 # ################################################################################ @GENERAL # # PREFIX EGFR_A1 PATH ../snapshot/ # COMPLEX 1 RECEPTOR 1 LIGAND 1 # COMPT ../EGFR_A1.prmtop RECPT ../EGFR.prmtop LIGPT ../A1.prmtop # GC 0 AS 0 DC 1 # MM 1 GB 1 PB 0 MS 0 # NM 0 # ################################################################################ @PB # # PROC 2 REFE 0 INDI 1.0 EXDI 80.0 SCALE 2 LINIT 1000 PRBRAD 1.4 ISTRNG 0.0 RADIOPT 0 NPOPT 1 CAVITY_SURFTEN 0.0072 CAVITY_OFFSET 0.00 # SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 # ################################################################################ @MM # # # DIELC 1.0 # ################################################################################ @GB # # # IGB 2 GBSA 2 SALTCON 0.00 EXTDIEL 80.0 INTDIEL 1.0 # SURFTEN 0.0072 SURFOFF 0.00 # ################################################################################ @MS # # PROBE 0.0 # ################################################################################ @DECOMP # # DCTYPE 2 # COMREC 1-317 COMLIG 318-318 COMPRI 1-318 RECRES 1-317 RECPRI 1-317 RECMAP 1-317 LIGRES 1-1 LIGPRI 1-1 LIGMAP 318-318 ################################################################################ @PROGRAMS # # Additional program executables can be defined here # # ################################################################################